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●啤酒工業：

添加中性蛋白酶分解蛋白質為多肽和游離氨基氮，特別對大麥，大豆等植物性蛋白作用，用于啤酒生產，可排除蛋白質產生的"冷混濁"現象。

●醫藥工業的應用：

含中性蛋白酶的藥物，可起到、利膽、、的。

●紡織工業的應用：

用中性蛋白酶處理過的羊毛，其抗張度比常規方法高，毛線手感柔軟，收縮性為0；還可用于蠶的脫膠和蠶絲的精煉。

●皮革工業的應用：

利用中性蛋白酶可制成脫毛劑，經鞣制的皮革，脫毛干凈，粒而清晰，無明顯損傷，毛孔細致光亮。

●飼料工業的應用：

加入飼料配方中或直接與混合飼料混合飼喂，可提高蛋白質的利用率和降低飼養成本。